Ocean Modeling Discussion

ROMS/TOMS

Search for:
It is currently Tue Jun 18, 2019 9:04 pm




Post new topic Reply to topic  [ 1 post ] 

All times are UTC

Author Message
PostPosted: Sun Apr 14, 2019 2:11 pm 
Offline

Joined: Mon Sep 08, 2014 4:17 pm
Posts: 12
Location: Hohai University
Hi I am testing the lake Jersey nesting case. However, results did show same as in the.
It is a constant temperature all the time.It might due to surface wind setting. May I know how to fix that by the analytical setting? Here is the log.file and also the my results and roms website results.
Thanks.

Code:
--------------------------------------------------------------------------------
 Model Input Parameters:  ROMS/TOMS version 3.7 
                          Saturday - April 13, 2019 -  6:01:01 PM
 --------------------------------------------------------------------------------

 Lake Jersey nesting test case , 4 grids: A, C, D, and E

 Operating system : Linux
 CPU/hardware     : x86_64
 Compiler system  : ifort
 Compiler command : /data/users/htimy/mpichinst/bin/mpif90
 Compiler flags   : -fp-model precise -ip -O3
 MPI Communicator : 1140850688  PET size = 36

 Input Script  : ocean_lake_jersey_nested_4g_acde.in

 SVN Root URL  : https:://myroms.org/svn/src
 SVN Revision  :

 Local Root    : /data/users/htimy/new_jeysey_lake/trunk
 Header Dir    : /data/users/htimy/new_jeysey_lake/trunk
 Header file   : lake_jersey.h
 Analytical Dir: /data/users/htimy/new_jeysey_lake/trunk

 Resolution, Grid 01: 0100x0080x008,  Parallel Nodes:  36,  Tiling: 006x006


 Physical Parameters, Grid: 01
 =============================

       1920  ntimes            Number of timesteps for 3-D equations.
     90.000  dt                Timestep size (s) for 3-D equations.
         30  ndtfast           Number of timesteps for 2-D equations between
                                 each 3D timestep.
          1  ERstr             Starting ensemble/perturbation run number.
          1  ERend             Ending ensemble/perturbation run number.
          0  nrrec             Number of restart records to read from disk.
          T  LcycleRST         Switch to recycle time-records in restart file.
         20  nRST              Number of timesteps between the writing of data
                                 into restart fields.
          1  ninfo             Number of timesteps between print of information
                                 to standard output.
          T  ldefout           Switch to create a new output NetCDF file(s).
         20  nHIS              Number of timesteps between the writing fields
                                 into history file.
          0  nQCK              Number of timesteps between the writing fields
                                 into quicksave file.
          F  LuvSponge         Turning OFF sponge on horizontal momentum.
          F  LtracerSponge(01) Turning OFF sponge on tracer 01: temp
          F  LtracerSponge(02) Turning OFF sponge on tracer 02: salt
 5.0000E-06  Akt_bak(01)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 01: temp
 5.0000E-06  Akt_bak(02)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 02: salt
 5.0000E-05  Akv_bak           Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for momentum.
 3.0000E-04  rdrg              Linear bottom drag coefficient (m/s).
 3.0000E-03  rdrg2             Quadratic bottom drag coefficient.
 1.5000E-02  Zob               Bottom roughness (m).
          1  Vtransform        S-coordinate transformation equation.
          1  Vstretching       S-coordinate stretching function.
 1.0000E+00  theta_s           S-coordinate surface control parameter.
 1.0000E+00  theta_b           S-coordinate bottom  control parameter.
     10.000  Tcline            S-coordinate surface/bottom layer width (m) used
                                 in vertical coordinate stretching.
   1025.000  rho0              Mean density (kg/m3) for Boussinesq approximation.
      0.000  dstart            Time-stamp assigned to model initialization (days).
       0.00  time_ref          Reference time for units attribute (yyyymmdd.dd)
 0.0000E+00  Tnudg(01)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 01: temp
 0.0000E+00  Tnudg(02)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 02: salt
 0.0000E+00  Znudg             Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for free-surface.
 0.0000E+00  M2nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 2D momentum.
 0.0000E+00  M3nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 3D momentum.
 0.0000E+00  obcfac            Factor between passive and active
                                 open boundary conditions.
          F  VolCons(1)        NLM western  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(2)        NLM southern edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(3)        NLM eastern  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(4)        NLM northern edge boundary volume conservation.
     10.000  T0                Background potential temperature (C) constant.
     30.000  S0                Background salinity (PSU) constant.
      1.000  gamma2            Slipperiness variable: free-slip (1.0) or
                                                      no-slip (-1.0).
          F  LuvSrc            Turning OFF momentum point Sources/Sinks.
          F  LwSrc             Turning OFF volume influx point Sources/Sinks.
          F  LtracerSrc(01)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 01: temp
          F  LtracerSrc(02)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 02: salt
          F  LsshCLM           Turning OFF processing of SSH climatology.
          F  Lm2CLM            Turning OFF processing of 2D momentum climatology.
          F  Lm3CLM            Turning OFF processing of 3D momentum climatology.
          F  LtracerCLM(01)    Turning OFF processing of climatology tracer 01: temp
          F  LtracerCLM(02)    Turning OFF processing of climatology tracer 02: salt
          F  LnudgeM2CLM       Turning OFF nudging of 2D momentum climatology.
          F  LnudgeM3CLM       Turning OFF nudging of 3D momentum climatology.
          F  LnudgeTCLM(01)    Turning OFF nudging of climatology tracer 01: temp
          F  LnudgeTCLM(02)    Turning OFF nudging of climatology tracer 02: salt

          T  Hout(idFsur)      Write out free-surface.
          T  Hout(idUbar)      Write out 2D U-momentum component.
          T  Hout(idVbar)      Write out 2D V-momentum component.
          T  Hout(idUvel)      Write out 3D U-momentum component.
          T  Hout(idVvel)      Write out 3D V-momentum component.
          T  Hout(idWvel)      Write out W-momentum component.
          T  Hout(idOvel)      Write out omega vertical velocity.
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 01: temp
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 02: salt

 Output/Input Files:

             Output Restart File:  ../output/lake_jersey_rst_a.nc
             Output History File:  ../output/lake_jersey_his_a.nc
                 Input Grid File:  ../input/lake_jersey_grd_a.nc
  Nesting grid connectivity File:  ../input/lake_jersey_ngc_4g_acde.nc
    Input Nonlinear Initial File:  ../input/lake_jersey_ini_a.nc

 Resolution, Grid 02: 0120x0130x008,  Parallel Nodes:  36,  Tiling: 006x006


 Physical Parameters, Grid: 02
 =============================

       9600  ntimes            Number of timesteps for 3-D equations.
     18.000  dt                Timestep size (s) for 3-D equations.
         30  ndtfast           Number of timesteps for 2-D equations between
                                 each 3D timestep.
          1  ERstr             Starting ensemble/perturbation run number.
          1  ERend             Ending ensemble/perturbation run number.
          0  nrrec             Number of restart records to read from disk.
          T  LcycleRST         Switch to recycle time-records in restart file.
        100  nRST              Number of timesteps between the writing of data
                                 into restart fields.
          1  ninfo             Number of timesteps between print of information
                                 to standard output.
          T  ldefout           Switch to create a new output NetCDF file(s).
        100  nHIS              Number of timesteps between the writing fields
                                 into history file.
          0  nQCK              Number of timesteps between the writing fields
                                 into quicksave file.
          F  LuvSponge         Turning OFF sponge on horizontal momentum.
          F  LtracerSponge(01) Turning OFF sponge on tracer 01: temp
          F  LtracerSponge(02) Turning OFF sponge on tracer 02: salt
 5.0000E-06  Akt_bak(01)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 01: temp
 5.0000E-06  Akt_bak(02)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 02: salt
 5.0000E-05  Akv_bak           Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for momentum.
 3.0000E-04  rdrg              Linear bottom drag coefficient (m/s).
 3.0000E-03  rdrg2             Quadratic bottom drag coefficient.
 1.5000E-02  Zob               Bottom roughness (m).
          1  Vtransform        S-coordinate transformation equation.
          1  Vstretching       S-coordinate stretching function.
 1.0000E+00  theta_s           S-coordinate surface control parameter.
 1.0000E+00  theta_b           S-coordinate bottom  control parameter.
     10.000  Tcline            S-coordinate surface/bottom layer width (m) used
                                 in vertical coordinate stretching.
   1025.000  rho0              Mean density (kg/m3) for Boussinesq approximation.
      0.000  dstart            Time-stamp assigned to model initialization (days).
       0.00  time_ref          Reference time for units attribute (yyyymmdd.dd)
 0.0000E+00  Tnudg(01)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 01: temp
 0.0000E+00  Tnudg(02)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 02: salt
 0.0000E+00  Znudg             Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for free-surface.
 0.0000E+00  M2nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 2D momentum.
 0.0000E+00  M3nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 3D momentum.
 0.0000E+00  obcfac            Factor between passive and active
                                 open boundary conditions.
          F  VolCons(1)        NLM western  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(2)        NLM southern edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(3)        NLM eastern  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(4)        NLM northern edge boundary volume conservation.
     10.000  T0                Background potential temperature (C) constant.
     30.000  S0                Background salinity (PSU) constant.
      1.000  gamma2            Slipperiness variable: free-slip (1.0) or
                                                      no-slip (-1.0).
          F  LuvSrc            Turning OFF momentum point Sources/Sinks.
          F  LwSrc             Turning OFF volume influx point Sources/Sinks.
          F  LtracerSrc(01)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 01: temp
          F  LtracerSrc(02)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 02: salt
          F  LsshCLM           Turning OFF processing of SSH climatology.
          F  Lm2CLM            Turning OFF processing of 2D momentum climatology.
          F  Lm3CLM            Turning OFF processing of 3D momentum climatology.
          F  LtracerCLM(01)    Turning OFF processing of climatology tracer 01: temp
          F  LtracerCLM(02)    Turning OFF processing of climatology tracer 02: salt
          F  LnudgeM2CLM       Turning OFF nudging of 2D momentum climatology.
          F  LnudgeM3CLM       Turning OFF nudging of 3D momentum climatology.
          F  LnudgeTCLM(01)    Turning OFF nudging of climatology tracer 01: temp
          F  LnudgeTCLM(02)    Turning OFF nudging of climatology tracer 02: salt

          T  Hout(idFsur)      Write out free-surface.
          T  Hout(idUbar)      Write out 2D U-momentum component.
          T  Hout(idVbar)      Write out 2D V-momentum component.
          T  Hout(idUvel)      Write out 3D U-momentum component.
          T  Hout(idVvel)      Write out 3D V-momentum component.
          T  Hout(idWvel)      Write out W-momentum component.
          T  Hout(idOvel)      Write out omega vertical velocity.
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 01: temp
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 02: salt

 Output/Input Files:

             Output Restart File:  ../output/lake_jersey_rst_c.nc
             Output History File:  ../output/lake_jersey_his_c.nc
                 Input Grid File:  ../input/lake_jersey_grd_c.nc
  Nesting grid connectivity File:  ../input/lake_jersey_ngc_4g_acde.nc
    Input Nonlinear Initial File:  ../input/lake_jersey_ini_c.nc

 Resolution, Grid 03: 0114x0060x008,  Parallel Nodes:  36,  Tiling: 006x006


 Physical Parameters, Grid: 03
 =============================

       5760  ntimes            Number of timesteps for 3-D equations.
     30.000  dt                Timestep size (s) for 3-D equations.
         30  ndtfast           Number of timesteps for 2-D equations between
                                 each 3D timestep.
          1  ERstr             Starting ensemble/perturbation run number.
          1  ERend             Ending ensemble/perturbation run number.
          0  nrrec             Number of restart records to read from disk.
          T  LcycleRST         Switch to recycle time-records in restart file.
         60  nRST              Number of timesteps between the writing of data
                                 into restart fields.
          1  ninfo             Number of timesteps between print of information
                                 to standard output.
          T  ldefout           Switch to create a new output NetCDF file(s).
         60  nHIS              Number of timesteps between the writing fields
                                 into history file.
          0  nQCK              Number of timesteps between the writing fields
                                 into quicksave file.
          F  LuvSponge         Turning OFF sponge on horizontal momentum.
          F  LtracerSponge(01) Turning OFF sponge on tracer 01: temp
          F  LtracerSponge(02) Turning OFF sponge on tracer 02: salt
 5.0000E-06  Akt_bak(01)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 01: temp
 5.0000E-06  Akt_bak(02)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 02: salt
 5.0000E-05  Akv_bak           Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for momentum.
 3.0000E-04  rdrg              Linear bottom drag coefficient (m/s).
 3.0000E-03  rdrg2             Quadratic bottom drag coefficient.
 1.5000E-02  Zob               Bottom roughness (m).
          1  Vtransform        S-coordinate transformation equation.
          1  Vstretching       S-coordinate stretching function.
 1.0000E+00  theta_s           S-coordinate surface control parameter.
 1.0000E+00  theta_b           S-coordinate bottom  control parameter.
     10.000  Tcline            S-coordinate surface/bottom layer width (m) used
                                 in vertical coordinate stretching.
   1025.000  rho0              Mean density (kg/m3) for Boussinesq approximation.
      0.000  dstart            Time-stamp assigned to model initialization (days).
       0.00  time_ref          Reference time for units attribute (yyyymmdd.dd)
 0.0000E+00  Tnudg(01)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 01: temp
 0.0000E+00  Tnudg(02)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 02: salt
 0.0000E+00  Znudg             Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for free-surface.
 0.0000E+00  M2nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 2D momentum.
 0.0000E+00  M3nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 3D momentum.
 0.0000E+00  obcfac            Factor between passive and active
                                 open boundary conditions.
          F  VolCons(1)        NLM western  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(2)        NLM southern edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(3)        NLM eastern  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(4)        NLM northern edge boundary volume conservation.
     10.000  T0                Background potential temperature (C) constant.
     30.000  S0                Background salinity (PSU) constant.
      1.000  gamma2            Slipperiness variable: free-slip (1.0) or
                                                      no-slip (-1.0).
          F  LuvSrc            Turning OFF momentum point Sources/Sinks.
          F  LwSrc             Turning OFF volume influx point Sources/Sinks.
          F  LtracerSrc(01)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 01: temp
          F  LtracerSrc(02)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 02: salt
          F  LsshCLM           Turning OFF processing of SSH climatology.
          F  Lm2CLM            Turning OFF processing of 2D momentum climatology.
          F  Lm3CLM            Turning OFF processing of 3D momentum climatology.
          F  LtracerCLM(01)    Turning OFF processing of climatology tracer 01: temp
          F  LtracerCLM(02)    Turning OFF processing of climatology tracer 02: salt
          F  LnudgeM2CLM       Turning OFF nudging of 2D momentum climatology.
          F  LnudgeM3CLM       Turning OFF nudging of 3D momentum climatology.
          F  LnudgeTCLM(01)    Turning OFF nudging of climatology tracer 01: temp
          F  LnudgeTCLM(02)    Turning OFF nudging of climatology tracer 02: salt

          T  Hout(idFsur)      Write out free-surface.
          T  Hout(idUbar)      Write out 2D U-momentum component.
          T  Hout(idVbar)      Write out 2D V-momentum component.
          T  Hout(idUvel)      Write out 3D U-momentum component.
          T  Hout(idVvel)      Write out 3D V-momentum component.
          T  Hout(idWvel)      Write out W-momentum component.
          T  Hout(idOvel)      Write out omega vertical velocity.
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 01: temp
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 02: salt

 Output/Input Files:

             Output Restart File:  ../output/lake_jersey_rst_d.nc
             Output History File:  ../output/lake_jersey_his_d.nc
                 Input Grid File:  ../input/lake_jersey_grd_d.nc
  Nesting grid connectivity File:  ../input/lake_jersey_ngc_4g_acde.nc
    Input Nonlinear Initial File:  ../input/lake_jersey_ini_d.nc

 Resolution, Grid 04: 0132x0060x008,  Parallel Nodes:  36,  Tiling: 006x006


 Physical Parameters, Grid: 04
 =============================

      17280  ntimes            Number of timesteps for 3-D equations.
     10.000  dt                Timestep size (s) for 3-D equations.
         30  ndtfast           Number of timesteps for 2-D equations between
                                 each 3D timestep.
          1  ERstr             Starting ensemble/perturbation run number.
          1  ERend             Ending ensemble/perturbation run number.
          0  nrrec             Number of restart records to read from disk.
          T  LcycleRST         Switch to recycle time-records in restart file.
        180  nRST              Number of timesteps between the writing of data
                                 into restart fields.
          1  ninfo             Number of timesteps between print of information
                                 to standard output.
          T  ldefout           Switch to create a new output NetCDF file(s).
        180  nHIS              Number of timesteps between the writing fields
                                 into history file.
          0  nQCK              Number of timesteps between the writing fields
                                 into quicksave file.
          F  LuvSponge         Turning OFF sponge on horizontal momentum.
          F  LtracerSponge(01) Turning OFF sponge on tracer 01: temp
          F  LtracerSponge(02) Turning OFF sponge on tracer 02: salt
 5.0000E-06  Akt_bak(01)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 01: temp
 5.0000E-06  Akt_bak(02)       Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for tracer 02: salt
 5.0000E-05  Akv_bak           Background vertical mixing coefficient (m2/s)
                                 for momentum.
 3.0000E-04  rdrg              Linear bottom drag coefficient (m/s).
 3.0000E-03  rdrg2             Quadratic bottom drag coefficient.
 1.5000E-02  Zob               Bottom roughness (m).
          1  Vtransform        S-coordinate transformation equation.
          1  Vstretching       S-coordinate stretching function.
 1.0000E+00  theta_s           S-coordinate surface control parameter.
 1.0000E+00  theta_b           S-coordinate bottom  control parameter.
     10.000  Tcline            S-coordinate surface/bottom layer width (m) used
                                 in vertical coordinate stretching.
   1025.000  rho0              Mean density (kg/m3) for Boussinesq approximation.
      0.000  dstart            Time-stamp assigned to model initialization (days).
       0.00  time_ref          Reference time for units attribute (yyyymmdd.dd)
 0.0000E+00  Tnudg(01)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 01: temp
 0.0000E+00  Tnudg(02)         Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for tracer 02: salt
 0.0000E+00  Znudg             Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for free-surface.
 0.0000E+00  M2nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 2D momentum.
 0.0000E+00  M3nudg            Nudging/relaxation time scale (days)
                                 for 3D momentum.
 0.0000E+00  obcfac            Factor between passive and active
                                 open boundary conditions.
          F  VolCons(1)        NLM western  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(2)        NLM southern edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(3)        NLM eastern  edge boundary volume conservation.
          F  VolCons(4)        NLM northern edge boundary volume conservation.
     10.000  T0                Background potential temperature (C) constant.
     30.000  S0                Background salinity (PSU) constant.
      1.000  gamma2            Slipperiness variable: free-slip (1.0) or
                                                      no-slip (-1.0).
          F  LuvSrc            Turning OFF momentum point Sources/Sinks.
          F  LwSrc             Turning OFF volume influx point Sources/Sinks.
          F  LtracerSrc(01)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 01: temp
          F  LtracerSrc(02)    Turning OFF point Sources/Sinks on tracer 02: salt
          F  LsshCLM           Turning OFF processing of SSH climatology.
          F  Lm2CLM            Turning OFF processing of 2D momentum climatology.
          F  Lm3CLM            Turning OFF processing of 3D momentum climatology.
          F  LtracerCLM(01)    Turning OFF processing of climatology tracer 01: temp
          F  LtracerCLM(02)    Turning OFF processing of climatology tracer 02: salt
          F  LnudgeM2CLM       Turning OFF nudging of 2D momentum climatology.
          F  LnudgeM3CLM       Turning OFF nudging of 3D momentum climatology.
          F  LnudgeTCLM(01)    Turning OFF nudging of climatology tracer 01: temp
          F  LnudgeTCLM(02)    Turning OFF nudging of climatology tracer 02: salt

          T  Hout(idFsur)      Write out free-surface.
          T  Hout(idUbar)      Write out 2D U-momentum component.
          T  Hout(idVbar)      Write out 2D V-momentum component.
          T  Hout(idUvel)      Write out 3D U-momentum component.
          T  Hout(idVvel)      Write out 3D V-momentum component.
          T  Hout(idWvel)      Write out W-momentum component.
          T  Hout(idOvel)      Write out omega vertical velocity.
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 01: temp
          T  Hout(idTvar)      Write out tracer 02: salt

 Output/Input Files:

             Output Restart File:  ../output/lake_jersey_rst_e.nc
             Output History File:  ../output/lake_jersey_his_e.nc
                 Input Grid File:  ../input/lake_jersey_grd_e.nc
  Nesting grid connectivity File:  ../input/lake_jersey_ngc_4g_acde.nc
    Input Nonlinear Initial File:  ../input/lake_jersey_ini_e.nc

 



 Maximum halo size in XI and ETA directions:

               HaloSizeI(3) =     102
               HaloSizeJ(3) =      75
                TileSide(3) =      28
                TileSize(3) =     532


 Maximum halo size in XI and ETA directions:

               HaloSizeI(4) =     111
               HaloSizeJ(4) =      75
                TileSide(4) =      31
                TileSize(4) =     589


 Lateral Boundary Conditions: NLM
 ============================

 Variable               Grid  West Edge    South Edge   East Edge    North Edge
 ---------              ----  ----------   ----------   ----------   ----------

 zeta                     1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 ubar                     1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 vbar                     1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 u                        1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 v                        1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 temp                     1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 salt                     1   Closed       Closed       Closed       Closed
                          2   Nested       Nested       Nested       Nested
                          3   Nested       Nested       Nested       Nested
                          4   Nested       Nested       Nested       Nested

 Activated C-preprocessing Options:

 LAKE_JERSEY         Lake Jersey nesting test case , 4 grids: A, C, D, and E
 ANA_BSFLUX          Analytical kinematic bottom salinity flux.
 ANA_BTFLUX          Analytical kinematic bottom temperature flux.
 ANA_SMFLUX          Analytical kinematic surface momentum flux.
 ANA_SSFLUX          Analytical kinematic surface salinity flux.
 ANA_STFLUX          Analytical kinematic surface temperature flux.
 !ASSEMBLE_ALL...    Using mpi_isend/mpi_recv in mp_assemble routine.
 ASSUMED_SHAPE       Using assumed-shape arrays.
 !BOUNDARY_ALLGATHER Using mpi_allreduce in mp_boundary routine.
 !COLLECT_ALL...     Using mpi_isend/mpi_recv in mp_collect routine.
 DJ_GRADPS           Parabolic Splines density Jacobian (Shchepetkin, 2002).
 DOUBLE_PRECISION    Double precision arithmetic.
 MASKING             Land/Sea masking.
 MPI                 MPI distributed-memory configuration.
 NESTING             Nesting grids: Composite and Refinement.
 NONLINEAR           Nonlinear Model.
 NONLIN_EOS          Nonlinear Equation of State for seawater.
 !ONE_WAY            Two-way nesting in refinement grids.
 POWER_LAW           Power-law shape time-averaging barotropic filter.
 PROFILE             Time profiling activated .
 REDUCE_ALLGATHER    Using mpi_allgather in mp_reduce routine.
 !RST_SINGLE         Double precision fields in restart NetCDF file.
 SALINITY            Using salinity.
 SOLVE3D             Solving 3D Primitive Equations.
 TS_C4HADVECTION     Fourth-order centered horizontal advection of tracers.
 TS_C4VADVECTION     Fourth-order centered vertical advection of tracers.
 UV_ADV              Advection of momentum.
 UV_COR              Coriolis term.
 UV_U3HADVECTION     Third-order upstream horizontal advection of 3D momentum.
 UV_C4VADVECTION     Fourth-order centered vertical advection of momentum.
 UV_QDRAG            Quadratic bottom stress.
 VAR_RHO_2D          Variable density barotropic mode.

 Process Information:


 INITIAL: Configuring and initializing forward nonlinear model ...
 *******

    GET_GRID    - Coriolis parameter at RHO-points: f
                   (Grid = 01, File: ../input/lake_jersey_grd_a.nc)
                   (Min =  1.00000000E-04 Max =  1.00000000E-04)

   
 Vertical S-coordinate System, Grid 01:

 level   S-coord     Cs-curve   Z   at hmin       at hc    half way     at hmax

     8   0.0000000   0.0000000        0.000       0.000       0.000       0.000
     7  -0.1250000  -0.1122656       -2.148      -1.250      -2.148      -2.148
     6  -0.2500000  -0.2350037       -4.380      -2.500      -4.380      -4.380
     5  -0.3750000  -0.3654529       -6.674      -3.750      -6.674      -6.674
     4  -0.5000000  -0.5000000       -9.000      -5.000      -9.000      -9.000
     3  -0.6250000  -0.6345471      -11.326      -6.250     -11.326     -11.326
     2  -0.7500000  -0.7649963      -13.620      -7.500     -13.620     -13.620
     1  -0.8750000  -0.8877344      -15.852      -8.750     -15.852     -15.852
     0  -1.0000000  -1.0000000      -18.000     -10.000     -18.000     -18.000

 Vertical S-coordinate System, Grid 02:

 level   S-coord     Cs-curve   Z   at hmin       at hc    half way     at hmax

     8   0.0000000   0.0000000        0.000       0.000       0.000       0.000
     7  -0.1250000  -0.1122656       -2.148      -1.250      -2.148      -2.148
     6  -0.2500000  -0.2350037       -4.380      -2.500      -4.380      -4.380
     5  -0.3750000  -0.3654529       -6.674      -3.750      -6.674      -6.674
     4  -0.5000000  -0.5000000       -9.000      -5.000      -9.000      -9.000
     3  -0.6250000  -0.6345471      -11.326      -6.250     -11.326     -11.326
     2  -0.7500000  -0.7649963      -13.620      -7.500     -13.620     -13.620
     1  -0.8750000  -0.8877344      -15.852      -8.750     -15.852     -15.852
     0  -1.0000000  -1.0000000      -18.000     -10.000     -18.000     -18.000

 Vertical S-coordinate System, Grid 03:

 level   S-coord     Cs-curve   Z   at hmin       at hc    half way     at hmax

     8   0.0000000   0.0000000        0.000       0.000       0.000       0.000
     7  -0.1250000  -0.1122656       -2.148      -1.250      -2.148      -2.148
     6  -0.2500000  -0.2350037       -4.380      -2.500      -4.380      -4.380
     5  -0.3750000  -0.3654529       -6.674      -3.750      -6.674      -6.674
     4  -0.5000000  -0.5000000       -9.000      -5.000      -9.000      -9.000
     3  -0.6250000  -0.6345471      -11.326      -6.250     -11.326     -11.326
     2  -0.7500000  -0.7649963      -13.620      -7.500     -13.620     -13.620
     1  -0.8750000  -0.8877344      -15.852      -8.750     -15.852     -15.852
     0  -1.0000000  -1.0000000      -18.000     -10.000     -18.000     -18.000

 Vertical S-coordinate System, Grid 04:

 level   S-coord     Cs-curve   Z   at hmin       at hc    half way     at hmax

     8   0.0000000   0.0000000        0.000       0.000       0.000       0.000
     7  -0.1250000  -0.1122656       -2.148      -1.250      -2.148      -2.148
     6  -0.2500000  -0.2350037       -4.380      -2.500      -4.380      -4.380
     5  -0.3750000  -0.3654529       -6.674      -3.750      -6.674      -6.674
     4  -0.5000000  -0.5000000       -9.000      -5.000      -9.000      -9.000
     3  -0.6250000  -0.6345471      -11.326      -6.250     -11.326     -11.326
     2  -0.7500000  -0.7649963      -13.620      -7.500     -13.620     -13.620
     1  -0.8750000  -0.8877344      -15.852      -8.750     -15.852     -15.852
     0  -1.0000000  -1.0000000      -18.000     -10.000     -18.000     -18.000

 
 Power filter parameters, Fgamma, gamma =  0.28400   0.18933

 Time Splitting Weights for Grid 02:    ndtfast =  30    nfast =  42
 ==================================

    Primary            Secondary            Accumulated to Current Step

 

 ndtfast, nfast =   30  42   nfast/ndtfast =  1.40000

 Centers of gravity and integrals (values must be 1, 1, approx 1/2, 1, 1):

    1.000000000000 1.047601458608 0.523800729304 1.000000000000 1.000000000000

 Power filter parameters, Fgamma, gamma =  0.28400   0.18933

 Metrics information for Grid 01:
 ===============================

 Minimum X-grid spacing, DXmin =  5.00000000E-01 km
 Maximum X-grid spacing, DXmax =  5.00000000E-01 km
 Minimum Y-grid spacing, DYmin =  5.00000000E-01 km
 Maximum Y-grid spacing, DYmax =  5.00000000E-01 km
 Minimum Z-grid spacing, DZmin =  2.14812514E+00 m
 Maximum Z-grid spacing, DZmax =  2.32637641E+00 m

 Minimum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum Coriolis   Courant Number =  9.00000000E-03


 Metrics information for Grid 02:
 ===============================

 Minimum X-grid spacing, DXmin =  1.00000000E-01 km
 Maximum X-grid spacing, DXmax =  1.00000000E-01 km
 Minimum Y-grid spacing, DYmin =  1.00000000E-01 km
 Maximum Y-grid spacing, DYmax =  1.00000000E-01 km
 Minimum Z-grid spacing, DZmin =  2.14812514E+00 m
 Maximum Z-grid spacing, DZmax =  2.32637641E+00 m

 Minimum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum Coriolis   Courant Number =  1.80000000E-03


 Metrics information for Grid 03:
 ===============================

 Minimum X-grid spacing, DXmin =  1.66666667E-01 km
 Maximum X-grid spacing, DXmax =  1.66666667E-01 km
 Minimum Y-grid spacing, DYmin =  1.66666667E-01 km
 Maximum Y-grid spacing, DYmax =  1.66666667E-01 km
 Minimum Z-grid spacing, DZmin =  2.14812514E+00 m
 Maximum Z-grid spacing, DZmax =  2.32637641E+00 m

 Minimum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum Coriolis   Courant Number =  3.00000000E-03


 Metrics information for Grid 04:
 ===============================

 Minimum X-grid spacing, DXmin =  5.55555556E-02 km
 Maximum X-grid spacing, DXmax =  5.55555556E-02 km
 Minimum Y-grid spacing, DYmin =  5.55555556E-02 km
 Maximum Y-grid spacing, DYmax =  5.55555556E-02 km
 Minimum Z-grid spacing, DZmin =  2.14812514E+00 m
 Maximum Z-grid spacing, DZmax =  2.32637641E+00 m

 Minimum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum barotropic Courant Number =  1.12755310E-01
 Maximum Coriolis   Courant Number =  1.00000000E-03


 Refined Nested Grid(s) Information:
 ==================================

 Refined    Donor   Refined   Timestep   Refined
  Grid      Grid    Scale      Ratio   Timesteps

    02        01       05      5.00000      05
    03        01       03      3.00000      03
    04        03       03      3.00000      03

 WARNING: Usually the number of Refined Timesteps must be the same
          as the Refined Scale for numerical stability.


 NLM: GET_STATE - Reading state initial conditions,                       0001-01-01 00:00:00.00
                   (Grid 01, t = 0.0000, File: lake_jersey_ini_a.nc, Rec=0001, Index=1)
                - free-surface
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - potential temperature
                   (Min =  1.05902920E+01 Max =  1.94097080E+01)
                - salinity
                   (Min =  3.32000313E+01 Max =  3.67999992E+01)

 NLM: GET_STATE - Reading state initial conditions,                       0001-01-01 00:00:00.00
                   (Grid 02, t = 0.0000, File: lake_jersey_ini_c.nc, Rec=0001, Index=1)
                - free-surface
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - potential temperature
                   (Min =  1.05902920E+01 Max =  1.94097080E+01)
                - salinity
                   (Min =  3.32000313E+01 Max =  3.67999992E+01)

 NLM: GET_STATE - Reading state initial conditions,                       0001-01-01 00:00:00.00
                   (Grid 03, t = 0.0000, File: lake_jersey_ini_d.nc, Rec=0001, Index=1)
                - free-surface
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - potential temperature
                   (Min =  1.05902920E+01 Max =  1.94097080E+01)
                - salinity
                   (Min =  3.32000310E+01 Max =  3.68000000E+01)

 NLM: GET_STATE - Reading state initial conditions,                       0001-01-01 00:00:00.00
                   (Grid 04, t = 0.0000, File: lake_jersey_ini_e.nc, Rec=0001, Index=1)
                - free-surface
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - vertically integrated v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - u-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - v-momentum component
                   (Min =  0.00000000E+00 Max =  0.00000000E+00)
                - potential temperature
                   (Min =  1.05902920E+01 Max =  1.94097080E+01)
                - salinity
                   (Min =  3.32000313E+01 Max =  3.67999992E+01)

 Basin information for Grid 01:

 Maximum grid stiffness ratios:  rx0 =   0.000000E+00 (Beckmann and Haidvogel)
                                 rx1 =   0.000000E+00 (Haney)

 Initial domain volumes:  TotVolume =  3.2467500000E+10 m3
                         MinCellVol =  5.3703128450E+05 m3
                         MaxCellVol =  5.8159410269E+05 m3
                            Max/Min =  1.0829799296E+00

 Basin information for Grid 02:

 Maximum grid stiffness ratios:  rx0 =   2.960595E-16 (Beckmann and Haidvogel)
                                 rx1 =   4.961602E-15 (Haney)

 Initial domain volumes:  TotVolume =  2.8080000000E+09 m3
                         MinCellVol =  2.1481251380E+04 m3
                         MaxCellVol =  2.3263764108E+04 m3
                            Max/Min =  1.0829799296E+00

 Basin information for Grid 03:

 Maximum grid stiffness ratios:  rx0 =   2.960595E-16 (Beckmann and Haidvogel)
                                 rx1 =   4.961602E-15 (Haney)

 Initial domain volumes:  TotVolume =  3.4200000000E+09 m3
                         MinCellVol =  5.9670142722E+04 m3
                         MaxCellVol =  6.4621566966E+04 m3
                            Max/Min =  1.0829799296E+00

 Basin information for Grid 04:

 Maximum grid stiffness ratios:  rx0 =   2.960595E-16 (Beckmann and Haidvogel)
                                 rx1 =   4.961602E-15 (Haney)

 Initial domain volumes:  TotVolume =  4.4000000000E+08 m3
                         MinCellVol =  6.6300158580E+03 m3
                         MaxCellVol =  7.1801741073E+03 m3
                            Max/Min =  1.0829799296E+00

 NL ROMS/TOMS: started time-stepping: (Grid: 01 TimeSteps: 000000000001 - 000000001920)
 NL ROMS/TOMS: started time-stepping: (Grid: 02 TimeSteps: 000000000001 - 000000009600)
 NL ROMS/TOMS: started time-stepping: (Grid: 03 TimeSteps: 000000000001 - 000000005760)
 NL ROMS/TOMS: started time-stepping: (Grid: 04 TimeSteps: 000000000001 - 000000017280)


 TIME-STEP YYYY-MM-DD hh:mm:ss.ss  KINETIC_ENRG   POTEN_ENRG    TOTAL_ENRG    NET_VOLUME  Grid
                     C => (i,j,k)       Cu            Cv            Cw         Max Speed

         0 0001-01-01 00:00:00.00  0.000000E+00  8.810744E+01  8.810744E+01  3.600000E+10  01
                       (000,00,0)  0.000000E+00  0.000000E+00  0.000000E+00  0.000000E+00
      DEF_HIS     - creating  history      file, Grid 01: ../output/lake_jersey_his_a.nc
      WRT_HIS     - wrote history     fields (Index=1,1) in record = 0000001               01



 Analytical header files used:

     ROMS/Functionals/ana_btflux.h
     ROMS/Functionals/ana_smflux.h
     ROMS/Functionals/ana_stflux.h

 ROMS/TOMS: DONE... Saturday - April 13, 2019 -  6:40:29 PM



Thanks.


Attachments:
File comment: roms website´╝Ü
https://www.myroms.org/wiki/Lake_Jersey_Refinement_Example_AC

roms_website.png
roms_website.png [ 177.33 KiB | Viewed 163 times ]
File comment: my roms run
myrun_results.png
myrun_results.png [ 18.1 KiB | Viewed 163 times ]
Top
 Profile  
Reply with quote  
Display posts from previous:  Sort by  
Post new topic Reply to topic  [ 1 post ] 

All times are UTC


Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 4 guests


You cannot post new topics in this forum
You cannot reply to topics in this forum
You cannot edit your posts in this forum
You cannot delete your posts in this forum
You cannot post attachments in this forum

Search for:
Jump to:  
Powered by phpBB® Forum Software © phpBB Group